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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
海南多举措促进旅游业回暖******url:https://m.gmw.cn/2023-01/12/content_1303251984.htm,id:1303251984
在海南三亚亚特兰蒂斯酒店，前台工作人员为游客办理入住手续（2022年12月29日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社发（王学 摄）
几名骑行而来的游客在海南文昌铜鼓岭景区交流（2022年12月28日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社记者 蒲晓旭 摄
游客在海口骑楼老街游玩（2022年12月31日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社记者 蒲晓旭 摄
游客在海南文昌淇水湾游玩（1月9日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社记者 蒲晓旭 摄
游客在海南三亚亚特兰蒂斯酒店水族馆参观游玩（2022年12月30日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社发（王学 摄）
游客在海南三亚南山文化旅游区参观游玩（2022年12月29日摄）。
2022年下半年以来，海南省旅文厅发放了5300万元旅游消费券，策划举办了上百场旅游宣传活动，引导鼓励全省景区、酒店、旅游综合体、免税店等市场主体推出丰富的产品套餐，全力以赴刺激旅游消费。元旦假期，海南省旅游接待游客101.68万人次，实现旅游总收入15.03亿元。
新华社发（陈文武 摄）
（文图：赵筱尘 巫邓炎）
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